生物化學(xué)總結(jié)
總結(jié)是事后對某一時期、某一項目或某些工作進行回顧和分析,從而做出帶有規(guī)律性的結(jié)論,它可以有效鍛煉我們的語言組織能力,快快來寫一份總結(jié)吧。但是總結(jié)有什么要求呢?下面是小編幫大家整理的生物化學(xué)總結(jié),僅供參考,大家一起來看看吧。
生物化學(xué)總結(jié) 篇1
第一章蛋白質(zhì)
第一節(jié)氨基酸的結(jié)構(gòu)與分類
一、氨基酸的結(jié)構(gòu)
組成蛋白質(zhì)的基本單位是氨基酸
在空間各原子有兩種排列方式:L—構(gòu)型與D—構(gòu)型,它們的關(guān)系就像左右手的關(guān)系,互為鏡像關(guān)系
二、氨基酸的分類:
1.按氨基酸分子中羧基與氨基的數(shù)目分:
酸性氨基酸:有天冬氨酸、谷氨酸;
堿性氨基酸:有賴氨酸、精氨酸、組氨酸;
中性氨基酸:有甘氨酸、丙氨酸、纈氨酸、亮氨酸、異亮氨酸、甲硫氨酸、半胱氨酸、苯丙氨酸、色氨酸、酪氨酸、脯氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、絲氨酸、蘇氨酸。
2.按側(cè)基R基的結(jié)構(gòu)特點分:脂肪族氨基酸
芳香族氨基酸:苯丙氨酸、色氨酸、酪氨酸雜環(huán)氨基酸:脯氨酸、組氨酸
3.按側(cè)基R基與水的關(guān)系分:
非極性氨基酸:有甘氨酸、丙氨酸、纈氨酸、亮氨酸、異亮氨酸、甲硫氨酸、半胱氨酸、苯丙氨酸、色氨酸、酪氨酸、脯氨酸;
極性不帶電氨基酸:天冬酰胺、谷氨酰胺、絲氨酸、蘇氨酸;極性帶電氨基酸:天冬氨酸、谷氨酸、賴氨酸、精氨酸、組氨酸。
4.按氨基酸是否能在人體內(nèi)合成分:必需氨基酸:指人體內(nèi)不能合成的氨基酸,必須從食物中攝取,有八種:賴氨酸、色氨酸、甲硫氨酸、笨丙氨酸、纈氨酸、亮氨酸、異亮氨酸、蘇氨酸。
非必需氨基酸:指人體內(nèi)可以合成的氨基酸。有十種。
半必需氨基酸:指人體內(nèi)可以合成但合成量不能滿足人體需要(特別是嬰幼兒時期)的氨基酸,有兩種:組氨酸、精氨酸。
各種蛋白質(zhì)都有特定的空間構(gòu)象,而特定的空間構(gòu)象又與它們特定的生物學(xué)功能相適應(yīng),蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能是高度統(tǒng)一的。
第三節(jié)蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)及分離純化一、蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)
。ㄒ唬┑鞍踪|(zhì)的兩性解離與等電點:
具有兩性解離的性質(zhì),因而也具有特定的等電點。
。ǘ┑鞍踪|(zhì)的膠體性質(zhì)
蛋白質(zhì)分子的顆粒直徑已達1~100nm,處于膠體顆粒的范圍。因此,蛋白質(zhì)具有親水溶膠的性質(zhì)。
布郎運動、丁道爾現(xiàn)象、電泳現(xiàn)象,不能通過半透膜,具有吸附能力。
蛋白質(zhì)分子表面的水化膜和表面電荷是穩(wěn)定蛋白質(zhì)親水溶膠的兩個重要因素。
電泳:帶電顆粒在電場中移動的現(xiàn)象。分子大小不同的蛋白質(zhì)所帶凈電荷密度不同,遷移率即異,在電泳時可以分開。
三)蛋白質(zhì)的變性
在某些物理或化學(xué)因素的作用下,蛋白質(zhì)嚴格的空間結(jié)構(gòu)被破壞(不包括肽鍵的斷裂),從而引起蛋白質(zhì)若干理化性質(zhì)和生物學(xué)性質(zhì)的改變,稱為蛋白質(zhì)的變性(denaturation)。引起蛋白質(zhì)變性的因素
、傥锢硪蛩兀焊邷、高壓、紫外線、電離輻射、超聲波等;
②化學(xué)因素:強酸、強堿、有機溶劑、重金屬鹽等。變性蛋白質(zhì)的性質(zhì)改變
物理性質(zhì):旋光性改變,溶解度下降,沉降率升高,粘度升高,光吸收度增加等; 化學(xué)性質(zhì):官能團反應(yīng)性增加,易被蛋白酶水解;
生物學(xué)性質(zhì):原有生物學(xué)活性喪失,抗原性改變。變性蛋白質(zhì)主要標志是生物學(xué)功能的喪失。溶解度降低,易形成沉淀析出,結(jié)晶能力喪失,分子形狀改變,肽鏈松散,反應(yīng)基團增加,易被酶消化; 變性蛋白質(zhì)分子互相凝集為固體的現(xiàn)象稱凝固。蛋白質(zhì)變性的可逆性
a)蛋白質(zhì)在體外變性后,絕大多數(shù)情況下是不能復(fù)性的;
b)如變性程度淺,蛋白質(zhì)分子的構(gòu)象未被嚴重破壞;或者蛋白質(zhì)具有特殊的分子結(jié)構(gòu),并經(jīng)特殊處理則可以復(fù)性。
(四)蛋白質(zhì)的沉淀反應(yīng) 加高濃度鹽類(鹽析):加鹽使蛋白質(zhì)沉淀析出。
分段鹽析:調(diào)節(jié)鹽濃度,可使混合蛋白質(zhì)溶液中的幾種蛋白質(zhì)分段析出。血清球蛋白(50%(NH4)2SO4飽和度),清蛋白(飽和(NH4)2SO4)。 加有機溶劑 加重金屬鹽
加生物堿試劑單寧酸、苦味酸、鉬酸、鎢酸、三氯乙酸能沉淀生物堿,稱生物堿試劑。
。┑鞍踪|(zhì)的顏色反應(yīng)
二、蛋白質(zhì)的分離與純化
。ㄒ唬}析與有機溶劑沉淀:
1.鹽析:
在蛋白質(zhì)溶液中加入大量中性鹽,以破壞蛋白質(zhì)的膠體性質(zhì),使蛋白質(zhì)從溶液中沉淀析出,稱為鹽析。 常用的中性鹽有:硫酸銨、氯化鈉、硫酸鈉等。 鹽析時,溶液的pH在蛋白質(zhì)的等電點處效果最好。 鹽析沉淀蛋白質(zhì)時,通常不會引起蛋白質(zhì)的變性。 分段鹽析: 半飽和硫酸銨溶液可沉淀血漿球蛋白,而飽和硫酸銨溶液可沉淀血漿清蛋白。
2.有機溶劑沉淀蛋白質(zhì)
凡能與水以任意比例混合的有機溶劑,如乙醇、甲醇、丙酮等,均可用于沉淀蛋白質(zhì)。 沉淀原理是:
、倜撍饔茫
、谑顾慕殡姵(shù)降低,蛋白質(zhì)溶解度降低。
。ǘ╇娪荆
。ㄈ╇x子交換層析
(四)凝膠過濾層析
。ㄎ澹┏匐x心:
利用物質(zhì)密度的不同,經(jīng)超速離心后,分布于不同的液層而分離。
超速離心也可用來測定蛋白質(zhì)的分子量,蛋白質(zhì)的分子量與其沉降系數(shù)S成正比
第四章酶
第一節(jié)酶的命名及分類
一、酶的命名
(1)習(xí)慣命名法:
根據(jù)其催化底物來命名;
根據(jù)所催化反應(yīng)的性質(zhì)來命名; 結(jié)合上述兩個原則來命名,
有時在這些命名基礎(chǔ)上加上酶的來源或其它特點。
(2)國際系統(tǒng)命名法
系統(tǒng)名稱包括底物名稱、構(gòu)型、反應(yīng)性質(zhì),最后加一個酶字。 例如:習(xí)慣名稱:谷丙轉(zhuǎn)氨酶系統(tǒng)名稱:丙氨酸:α-酮戊二酸氨基轉(zhuǎn)移酶
酶催化的反應(yīng):谷氨酸+丙酮酸 →α-酮戊二酸+丙氨酸
二、酶的分類
(1)水解酶hydrolase
c)水解酶催化底物的加水分解反應(yīng)。
d)主要包括淀粉酶、蛋白酶、核酸酶及脂酶等。
e)例如,脂肪酶(Lipase)催化的脂的水解反應(yīng):
(2)氧化-還原酶Oxidoreductase
氧化-還原酶催化氧化-還原反應(yīng)。
主要包括脫氫酶(dehydrogenase)和氧化酶(Oxidase)。 如,乳酸(Lactate)脫氫酶催化乳酸的
脫氫反應(yīng)。
(3)轉(zhuǎn)移酶Transferase
轉(zhuǎn)移酶催化基團轉(zhuǎn)移反應(yīng),即將一個底物分子的基團或原子轉(zhuǎn)移到另一個底物的分子上。 例如,谷丙轉(zhuǎn)氨酶催化的氨基轉(zhuǎn)移反應(yīng)。
(4)裂合酶Lyase
裂合酶催化從底物分子中移去一個基團或原子形成雙鍵的反應(yīng)及其逆反應(yīng)。 主要包括醛縮酶、水化酶及脫氨酶等。 例如,延胡索酸水合酶催化的反應(yīng)。
(5)異構(gòu)酶Isomerase 異構(gòu)酶催化各種同分異構(gòu)體的相互轉(zhuǎn)化,即底物分子內(nèi)基團或原子的重排過程。
(6)合成酶LigaseorSynthetase
6.合成酶,又稱為連接酶,能夠催化C-C、C-O、C-N以及C-S鍵的形成反應(yīng)。這類反應(yīng)必須與ATP分解反應(yīng)相互偶聯(lián)。
7.A+B+ATP+H-O-H===A B+ADP+Pi8.例如,丙酮酸羧化酶催化的反應(yīng)。丙酮酸+CO2→草酰乙酸
(7)核酶(催化核酸)ribozyme
核酶是唯一的非蛋白酶。它是一類特殊的RNA,能夠催化RNA分子中的磷酸酯鍵的水解及其逆反應(yīng)。
第二節(jié)維生素與輔酶
維生素是機體維持正常生命活動所必不可少的一類有機物質(zhì)。
維生素一般習(xí)慣分為脂溶性和水溶性兩大類。其中脂溶性維生素在體內(nèi)可直接參與代謝的調(diào)節(jié)作用,而水溶性維生素是通過轉(zhuǎn)變成輔酶對代謝起調(diào)節(jié)作用。輔酶coenzyme和金屬離子
根據(jù)酶的組成情況,可以將酶分為兩大類: 單純蛋白酶:它們的組成為單一蛋白質(zhì)。結(jié)合蛋白酶:某些酶,例如氧化-還原酶等,其分子中除了蛋白質(zhì)外,還含有非蛋白組分。 結(jié)合蛋白酶的蛋白質(zhì)部分稱為酶蛋白,非蛋白質(zhì)部分包括輔酶及金屬離子(或輔因子cofactor)。 酶蛋白與輔助成分組成的完整分子稱為全酶。單純的酶蛋白無催化功能。
一、水溶性維生素與輔酶
某些小分子有機化合物與酶蛋白結(jié)合在一起并協(xié)同實施催化作用,這類分子被稱為輔酶(或輔基)。輔酶是一類具有特殊化學(xué)結(jié)構(gòu)和功能的化合物。參與的'酶促反應(yīng)主要為氧化-還原反應(yīng)或基團轉(zhuǎn)移反應(yīng)。大多數(shù)輔酶的前體主要是水溶性B族維生素。許多維生素的生理功能與輔酶的作用密切相關(guān)。
酶可同時與底物及抑制劑結(jié)合,引起酶分子構(gòu)象變化,并導(dǎo)至酶活性下降。由于這類物質(zhì)并不是與底物競爭與活性中心的結(jié)合,所以稱為非競爭性抑制劑。
(3).反競爭性抑制含義和反應(yīng)式
反競爭性抑制劑必須在酶結(jié)合了底物之后才能與酶與底物的中間產(chǎn)物結(jié)合,該抑制劑與單獨的酶不結(jié)合。反競爭性抑制的特點:
反競爭性抑制劑的化學(xué)結(jié)構(gòu)不一定與底物的分子結(jié)構(gòu)類似; 抑制劑與底物可同時與酶的不同部位結(jié)合;
必須有底物存在,抑制劑才能對酶產(chǎn)生抑制作用;抑制程度隨底物濃度的增加而增加; 動力學(xué)參數(shù):Km減小,Vm降低。第六節(jié)酶的調(diào)節(jié)
生物體內(nèi)的各種生理活動均以一定的物質(zhì)代謝為基礎(chǔ)。為了適應(yīng)某種生理活動的變化,需要對一定的代謝活動進行調(diào)節(jié)。
通過對酶的催化活性的調(diào)節(jié),就可以達到調(diào)節(jié)代謝活動的目的。
可以通過改變其催化活性而使整個代謝反應(yīng)的速度或方向發(fā)生改變的酶就稱為限速酶或關(guān)鍵酶。
一、酶結(jié)構(gòu)的調(diào)節(jié)
酶結(jié)構(gòu)的調(diào)節(jié)是通過對現(xiàn)有酶分子結(jié)構(gòu)的影響來改變酶的催化活性的調(diào)節(jié)方式。 酶結(jié)構(gòu)的調(diào)節(jié)是一種快速調(diào)節(jié)方式。
。ㄒ唬┳儤(gòu)調(diào)節(jié)(別構(gòu)調(diào)節(jié)):
某些代謝物能與變構(gòu)酶分子上的變構(gòu)部位特異性結(jié)合,使酶的分子構(gòu)象發(fā)生改變,從而改變酶的催化活性以及代謝反應(yīng)的速度,這種調(diào)節(jié)作用就稱為變構(gòu)調(diào)節(jié)(allostericregulation)。 具有變構(gòu)調(diào)節(jié)作用的酶就稱為變構(gòu)酶。
凡能使酶分子變構(gòu)并使酶的催化活性發(fā)生改變的代謝物就稱為變構(gòu)劑。
1.變構(gòu)調(diào)節(jié)的機制:
變構(gòu)酶一般是多亞基構(gòu)成的聚合體,一些亞基為催化亞基,另一些亞基為調(diào)節(jié)亞基。 當(dāng)調(diào)節(jié)亞基或調(diào)節(jié)部位與變構(gòu)劑結(jié)合后,就可導(dǎo)致酶的空間構(gòu)象發(fā)生改變,從而導(dǎo)致酶的催化活性中心的構(gòu)象發(fā)生改變而致酶活性的改變。
2.協(xié)同效應(yīng):
3.變構(gòu)調(diào)節(jié)的方式:
4.變構(gòu)調(diào)節(jié)的特點:
、琶富钚缘母淖兺ㄟ^酶分子構(gòu)象的改變而實現(xiàn);
、泼傅淖儤(gòu)僅涉及非共價鍵的變化;
、钦{(diào)節(jié)酶活性的因素為代謝物;
、葹橐环呛哪苓^程;
⑸無放大效應(yīng)。
(二)共價修飾調(diào)節(jié):
酶蛋白分子中的某些基團可以在其他酶的催化下發(fā)生共價修飾,從而導(dǎo)致酶活性的改變,稱為共價修飾調(diào)節(jié)。
共價修飾調(diào)節(jié)也是體內(nèi)快速調(diào)節(jié)代謝活動的一種重要的方式。
最常見的共價修飾方式有:磷酸化-脫磷酸化,-SH--S-S-,乙酰化-脫乙;佘栈-脫腺苷化等。
1.共價修飾的機制:共價修飾酶通常在兩種不同的酶的催化下發(fā)生修飾或去修飾,從而引起酶分子在有活性形式與無活性形式之間進行相互轉(zhuǎn)變。
2.共價修飾調(diào)節(jié)的方式:共價修飾調(diào)節(jié)一般與激素的調(diào)節(jié)相聯(lián)系,其調(diào)節(jié)方式為級聯(lián)反應(yīng)。
3.共價修飾調(diào)節(jié)的特點:
、琶敢詢煞N不同修飾和不同活性的形式存在;
⑵有共價鍵的變化;
⑶受其他調(diào)節(jié)因素(如激素)的影響;
、纫话銥楹哪苓^程;
、纱嬖诜糯笮(yīng)。
。ㄈ┩っ傅恼{(diào)節(jié)同工酶(isoenzyme)是指催化的化學(xué)反應(yīng)相同,酶蛋白的分子結(jié)構(gòu)、理化性質(zhì)乃至免疫學(xué)性質(zhì)不同的一組酶。這類酶存在于生物的同一種屬或同一個體的不同組織、甚至同一組織或細胞中。
第七節(jié)酶的分離提純及活力測定
一、酶的分離提純
(一)酶在細胞中的分布:
胞外酶:水解酶類,易收集,不必破碎細胞,緩沖液或水浸泡細胞或發(fā)酵液離心得到上清液即為含酶液。胞內(nèi)酶:除水解酶類外的其它酶類,需破碎細胞,不同的酶分布部位不同,最好先將酶存在的細胞器分離后再破碎該細胞器,然后將酶用適當(dāng)?shù)木彌_溶液或水抽提。
。ㄈ┰瓌t:
在增加酶得率和純度的同時,盡可能避免高溫、過酸、過堿、劇烈的震蕩及其它可能使酶喪失活力的一切操作過程。盡最大可能保存酶的活力。(四)分離提純:
1.酶的抽提:將酶溶解出來就稱為抽提。
胞外酶:固體培養(yǎng)的菌體加水或適當(dāng)緩沖溶液浸泡過濾即可。液體培養(yǎng)的菌體將發(fā)酵液離心分離除去菌體收集離心液即可。
胞內(nèi)酶:先破碎細胞,再用水或適當(dāng)?shù)木彌_溶液抽提。
2.酶的純化:純化的關(guān)鍵是維持酶的活性,因為隨著酶的逐漸提純,一些天然的可保持酶活力的其它成分逐漸減少,酶的穩(wěn)定性變差,所以整個純化過程應(yīng)維持低溫。
。1)酶的沉淀方法:與蛋白質(zhì)的沉淀方法相同,常用:
A.鹽析法:常用硫酸銨鹽析,有分段鹽析和一次性鹽析兩種方法。
B.有機溶劑沉淀法:用乙醇、丙酮等。應(yīng)低溫操作,溶劑少量分批加入。
。2)酶的純化方法:有吸附層析、離子交換層析、凝膠過濾層析、親和層析等。
3.酶的結(jié)晶:
純化以后的酶液再次沉淀,仍采用沉淀法。
4.酶的保存:一般在-20℃以下低溫保存。
二、酶活力的測定定性鑒定提取物中某一酶是否存在,一般是根據(jù)此酶引起的化學(xué)反應(yīng)來判斷。
酶活力的測定:實際上是酶定量測定的方法,酶制劑因含雜質(zhì)多易失活等原因,故不能用稱重或測量體積來定量。
。ㄒ唬┟富盍Φ母拍睿褐该复呋囟ɑ瘜W(xué)反應(yīng)的能力。其大小通常用在一定條件下酶催化某一特定化學(xué)反應(yīng)的速度來表示。一定量的酶制劑催化某一化學(xué)反應(yīng)速度快,活力大;反之,活力小。
速度表示法常用-dS/dt或dP/dt,測初速度,多用后者。因為反應(yīng)初期底物過量,底物的減少量不容易測定,而產(chǎn)物從無到有,易測定。
。ǘ┟傅幕盍挝唬1961年國際生化協(xié)會酶學(xué)委員會統(tǒng)一規(guī)定,酶的國際單位(IU)規(guī)定為:在最適反應(yīng)條件(溫度25℃)下,每分鐘內(nèi)催化1微摩爾(μmol)底物轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物所需的酶量(或1分鐘內(nèi)轉(zhuǎn)化底物生成1微摩爾產(chǎn)物的酶量)稱為1標準單位。 測定條件:最佳的反應(yīng)條件,如最適的Tm(或25℃)、pHm、[S]>>[E]、初速度下。
1972年國際生化協(xié)會又推薦一種新單位,即Katal(Kat)單位。規(guī)定:在最適溫度下,每秒鐘能催化1摩爾底物轉(zhuǎn)化為稱為所需要的酶量定義為1Kat。1Kat=60×106IU.
(三)酶的比活力:每單位酶蛋白所含的活力單位數(shù)。對固體酶:用活力單位/毫克酶蛋白、或活力單位/毫克酶蛋白氮來表示,對液體酶:用活力單位/毫升酶液來表示。很明顯,比活力越大,酶的活力越大。
。ㄋ模、酶活力的測定方法
1、分光光度法:產(chǎn)物與適當(dāng)?shù)幕瘜W(xué)試劑生成有色物質(zhì)或產(chǎn)物有紫外吸收的能力可采用此法。
2、測壓法:產(chǎn)物中有氣體,測氣壓增加量。
3、滴定法:產(chǎn)物中有酸生成,用堿滴定。
4、熒光法:產(chǎn)物中有熒光物質(zhì)生成或產(chǎn)物與熒光試劑反應(yīng)生成熒光產(chǎn)物可用此法。
5、旋光法:產(chǎn)物中有旋光物質(zhì)可采用此法。
除了以上方法外,還可根據(jù)產(chǎn)物的性質(zhì)采用其它方法
生物化學(xué)總結(jié) 篇2
一、核酸的分子組成:
基本組成單位是核苷酸,而核苷酸則由堿基、戊糖和磷酸三種成分連接而成。
兩類核酸:脫氧核糖核酸(DNA),存在于細胞核和線粒體內(nèi)。
核糖核酸(RNA),存在于細胞質(zhì)和細胞核內(nèi)。
1、戊糖:DNA分子的核苷酸的糖是β-D-2-脫氧核糖,RNA中為β-D-核糖。
2、磷酸:生物體內(nèi)多數(shù)核苷酸的磷酸基團位于核糖的第五位碳原子上。
二、核酸的一級結(jié)構(gòu)
核苷酸在多肽鏈上的排列順序為核酸的一級結(jié)構(gòu),核苷酸之間通過3′,5′磷酸二酯鍵連接。
三、DNA的空間結(jié)構(gòu)與功能
1、DNA的二級結(jié)構(gòu)
DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)是核酸的二級結(jié)構(gòu)。雙螺旋的骨架由糖和磷酸基構(gòu)成,兩股鏈之間的堿基互補配對,是遺傳信息傳遞者,DNA半保留復(fù)制的基礎(chǔ),結(jié)構(gòu)要點:
a.DNA是一反向平行的互補雙鏈結(jié)構(gòu)親水的脫氧核糖基和磷酸基骨架位于雙鏈的外側(cè),而堿基位于內(nèi)側(cè),堿基之間以氫鍵相結(jié)合,其中,腺嘌呤始終與胸腺嘧啶配對,形成兩個氫鍵,鳥嘌呤始終與胞嘧啶配對,形成三個氫鍵。
b.DNA是右手螺旋結(jié)構(gòu)螺旋直徑為2nm。每旋轉(zhuǎn)一周包含了10個堿基,每個堿基的旋轉(zhuǎn)角度為36度。螺距為3.4nm,每個堿基平面之間的距離為0.34nm。
c.DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)穩(wěn)定的維系橫向靠互補堿基的氫鍵維系,縱向則靠堿基平面間的疏水性堆積力維持,尤以后者為重要。
2、DNA的三級結(jié)構(gòu)
三級結(jié)構(gòu)是在雙螺旋基礎(chǔ)上進一步扭曲形成超螺旋,使體積壓縮。在真核生物細胞核內(nèi),DNA三級結(jié)構(gòu)與一組組蛋白共同組成核小體。在核小體的基礎(chǔ)上,DNA鏈經(jīng)反復(fù)折疊形成染色體。
3、功能
DNA的基本功能就是作為生物遺傳信息復(fù)制的模板和基因轉(zhuǎn)錄的.模板,它是生命遺傳繁殖的物質(zhì)基礎(chǔ),也是個體生命活動的基礎(chǔ)。
DNA中的核糖和磷酸構(gòu)成的分子骨架是沒有差別的,不同區(qū)段的DNA分子只是堿基的排列順序不同。
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