福建醫(yī)科大學(xué)前身是創(chuàng)辦于1937年的福建省立醫(yī)學(xué)?茖W(xué)校,1939年改名為福建省立醫(yī)學(xué)院,1949年改稱福建醫(yī)學(xué)院,1969年與福建中醫(yī)學(xué)院、華僑大學(xué)醫(yī)療系合并,成立福建醫(yī)科大學(xué)。1982年更名為福建醫(yī)學(xué)院,1996年4月更名為福建醫(yī)科大學(xué)。2003年,被福建省人民政府確定為重點建設(shè)高校,同年以良好的成績通過了教育部本科教學(xué)工作水平評估。
截至2020年7月,學(xué)校有上街、臺江2個校區(qū),規(guī)劃占地約1500畝;設(shè)有21個學(xué)院(部),28個本科專業(yè);有博士后科研流動站2個,博士后工作站4個,一級學(xué)科博士學(xué)位授權(quán)點6個,博士專業(yè)學(xué)位授權(quán)點2個,一級學(xué)科碩士學(xué)位授權(quán)點8個。碩士專業(yè)學(xué)位授權(quán)點6個;有教職醫(yī)護(hù)員工11900多人(含附屬醫(yī)院),在校全日制學(xué)生16000多人;有專任教師1595人,其中具有博士學(xué)位教師占43.7%,教授505人,副教授610人;學(xué)校博士點總數(shù)位居全國獨立設(shè)置醫(yī)學(xué)院校(含軍隊院校)第8名;有國家級重點學(xué)科(專科)12個,省級重點學(xué)科(專科)56個;擁有72個省部級科研平臺;擁有6所直屬附屬醫(yī)院,5所臨床醫(yī)學(xué)院,15所非直屬附屬醫(yī)院,23所臨床教學(xué)醫(yī)院。